Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcc1O35379 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcc1O35379 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms