Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kpna6O35345 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kpna6O35345 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms