Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh2d1bO35324 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh2d1bO35324 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms