Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bhlhe40O35185 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlhe40O35185 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms