Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smad6O35182 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms