Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NumblO08919 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NumblO08919 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NumblO08919 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NumblO08919 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NumblO08919 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NumblO08919 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NumblO08919 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NumblO08919 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NumblO08919 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NumblO08919 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NumblO08919 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NumblO08919 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NumblO08919 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms