Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf6O08584 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf6O08584 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf6O08584 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf6O08584 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf6O08584 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf6O08584 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms