Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec22bO08547 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms