Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C9

Vmn1r117, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r117L7N2C9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r117L7N2C9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Vmn1r117L7N2C9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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