Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm2056J3QQ02 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms