Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8888J3QPX5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Gm8888J3QPX5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm8888J3QPX5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm8888J3QPX5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm8888J3QPX5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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