Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5108J3QP01 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm5108J3QP01 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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