Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shisa8J3QNX5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms