Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Gm20918J3QN17 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm20918J3QN17 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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