Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gm3415J3QMS8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gm3415J3QMS8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Gm3415J3QMS8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Gm3415J3QMS8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Gm3415J3QMS8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Gm3415J3QMS8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Gm3415J3QMS8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Gm3415J3QMS8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Gm3415J3QMS8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3415J3QMS8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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