Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700014D04RikJ3QMS2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700014D04RikJ3QMS2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms