Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp994J3QM38 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp994J3QM38 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp994J3QM38 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp994J3QM38 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp994J3QM38 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp994J3QM38 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zfp994J3QM38 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp994J3QM38 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp994J3QM38 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zfp994J3QM38 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zfp994J3QM38 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zfp994J3QM38 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp994J3QM38 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zfp994J3QM38 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp994J3QM38 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Zfp994J3QM38 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Zfp994J3QM38 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfp994J3QM38 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Zfp994J3QM38 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp994J3QM38 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Zfp994J3QM38 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms