Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34c3J3QJW5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34c3J3QJW5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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