Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pot1bH7BX60 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pot1bH7BX60 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms