Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tubgcp6G5E8P0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubgcp6G5E8P0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms