Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn1r34G3XA52 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Vmn1r34G3XA52 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms