Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcf11G3X9Z4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcf11G3X9Z4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms