Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hmgxb3G3X9M3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms