Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20509G3UZF1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20509G3UZF1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms