Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Vmn1r167G3UW71 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Vmn1r167G3UW71 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r167G3UW71 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Vmn1r167G3UW71 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Vmn1r167G3UW71 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn1r167G3UW71 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn1r167G3UW71 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn1r167G3UW71 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Vmn1r167G3UW71 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r167G3UW71 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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