Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Srp72F8VQC1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Srp72F8VQC1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms