Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Colca2F8VPY8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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