Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9yF8VPU6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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