Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Farp1F8VPU2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms