Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arid4aF8VPQ2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arid4aF8VPQ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms