Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Crocc2F6XLV1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Crocc2F6XLV1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms