Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933403O08RikF6UK53 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933403O08RikF6UK53 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms