Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms