Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cald1E9QA15 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cald1E9QA15 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms