Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms