Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc74aE9Q9U8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc74aE9Q9U8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms