Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rdh16f1E9Q9P8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rdh16f1E9Q9P8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rdh16f1E9Q9P8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rdh16f1E9Q9P8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rdh16f1E9Q9P8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rdh16f1E9Q9P8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rdh16f1E9Q9P8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh16f1E9Q9P8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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