Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc141E9Q8Q6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc141E9Q8Q6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc141E9Q8Q6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms