Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6J4

Ceacam3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam3E9Q6J4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ceacam3E9Q6J4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms