Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC051665E9Q623 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms