Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17728E9Q5K2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17728E9Q5K2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms