Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms