Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc71lE9Q4T4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc71lE9Q4T4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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