Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pgbd1E9Q492 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms