Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd1E9Q3H4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd1E9Q3H4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms