Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NebE9Q1W3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms