Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.3■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Ccdc171E9Q1U1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc171E9Q1U1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Ccdc171E9Q1U1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Ccdc171E9Q1U1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Ccdc171E9Q1U1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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