Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm3095E9Q058 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm3095E9Q058 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms