Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scaf11E9PZM7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scaf11E9PZM7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms