Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp4E9PYK3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp4E9PYK3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp4E9PYK3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Parp4E9PYK3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms